에가디호의 잔해는 2009년 SDSS(M. Arena, M. Cottafava) 팀에 의해 북위 35°37', 동경 012°11', 람페두사 섬 북서쪽 약 22마일 지점, 수심 76미터 해저에서 용골이 아래로 향한 채 발견되었습니다. 잔해는 선수루 시작 부분 선체 측면에 두 개의 큰 절단면이 있는 단일 선체 형태로, 선수루 부분은 나머지 선체에서 거의 완전히 분리되어 있습니다. 함선에 장착되었던 두 문의 소형 대포는 포신이 하늘을 향해 선미 쪽으로 향한 채 제자리에 남아 있습니다.

선체 금속판 대부분이 떨어져 나가 바닥으로 가라앉았다. 조타실이 있던 구조물은 파괴되어 하나 이상의 대형 어망으로 덮여 있다. 기관실 갑판실은 남아 있으며 굴뚝의 일부가 그대로 남아 있고, 선미 갑판실도 마찬가지다.

프로펠러는 제자리에 있습니다. 배의 종은 2019년에 바닥에 떨어져 있는 채로 발견되어 함수포 아래에 놓여 있었습니다. 이 종은 시칠리아 주 해양 관리국의 요청으로 박물관에 전시될 예정입니다.

대형 그물을 잘라내고 일부를 제거하자 난파선에 의해 쓰러져 반쯤 묻혀 있던 특징적인 나침반 받침대와 조타 장치가 발견되었으며, 이 두 유물은 해양감독청의 요청에 따라 복원 및 박물관 전시를 위해 인양되었습니다.

2020년, 고스트 다이버스 조직과의 공동 작업 중 난파선 선미를 덮고 있던 대형 트롤 그물이 인양되었습니다.
에가디호의 장엄한 잔해는 이탈리아 당국에 의해 보호되고 있습니다.